Ngày 19 tháng 04 năm 1974, Viện Công nghiệp rừng được thành lập trên cơ sở Công ty Thiết kế Công trình Công nghiệp, PGS.TS. Nguyễn Hữu Quang, Chủ nhiệm Khoa Công nghiệp rừng của Trường Đại học lâm nghiệp được bổ nhiệm làm Viện trưởng (sau này là Thứ trưởng Bộ Lâm nghiệp). Ngoài lực lượng cán bộ khoa học của Công ty Thiết kế Công trình Công nghiệp, còn một số cán bộ chuyên môn từ các đơn vị khác trong ngành lâm nghiệp được Tổng cục Lâm nghiệp đưa về Viện. Khi thành lập, Viện xây dựng thêm các Bộ môn vận xuất, vận chuyển lâm sản, các xưởng, trạm nghiên cứu khảo nghiệm.
Năm 1988, Viện Công nghiệp rừng sáp nhập với Viện Lâm nghiệp và Viện Kinh tế Lâm nghiệp thành Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam ngày nay.
Ngày 13 tháng 12 năm 2012, Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn ban hành Quyết định số 3135/QĐ-BNN-TCCB về việc: Quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Viện Nghiên cứu Công nghiệp rừng trên cơ sở sắp xếp, tổ chức lại và nâng cấp các đơn vị thuộc Viện Khoa học lâm nghiệp Việt Nam: Trung tâm Nghiên cứu và Chuyển giao công nghệ Công nghiệp rừng; Phòng Nghiên cứu Chế biến lâm sản; Phòng Nghiên cứu Bảo quản lâm sản và Phòng Nghiên cứu Tài nguyên thực vật rừng.